美媒爆料美疾控中心新冠检测试剂盒污染导致检测延误疫情扩展

放大字体  缩小字体 2020-04-20 16:17:27  阅读:8305 来源:腾讯生活作者:责任编辑NO。邓安翔0215

当地时间4月18号,以深度调查而著名的《华盛顿邮报》(washington Post)长文揭秘了一个重磅消息:美国疾病控制与预防中心(CDC)因为实验室污染导致全美新冠检测延迟6周左右

粗略的说,CDC的实验室污染问题新冠检测试剂盒生产延误,从而导致全美新冠检测工作被延迟。原因是CDC生产试剂盒的实验室违反了合理的生产规范,同时严格的监督措施也不到位,导致用于高灵敏度检测过程的三个测试组件之一受到污染。

在1月下旬,全国26个公共卫生实验室在收到CDC的试剂盒后,24个实验室出现了假阳性反应,从而引发对试剂盒缺陷的关注。随后美国食品药品监督管理局(FDA)声明,测试盒的设计是正确的,不合格的生产操作是导致试剂盒出问题的原因。华盛顿邮报经过对30多名现任和前任联邦政府科学家,及其他知情人士的采访后了解到,在出现一些明显的异常问题后CDC花了一个多月的时间才移除不必要的操作,加剧了在生产和分发试剂盒上的延误,从而导致了全国范围内的检测延误。

在跟踪采访的过程中,很多人要求匿名,因为他们没有正真获得公开评论的授权。华盛顿邮报曾以报道著名的“水门事件”而出名,该事件让美国第36届总统尼克松被弹劾。

最开始,试剂盒的开发和推出是由美国卫生与公众服务部(Department of Health and Human Services)牵头。2020年1月12日,中国政府公布了新型冠状病毒的基因序列,CDC的科学家根据这一基因序列来设计一个检测冠状病毒感染的试剂盒。

负责该设计工作的是CDC病毒性疾病部门,由斯蒂芬 林德斯特伦(Stephen Lindstrom)牵头。Lindstrom是一位成就颇丰的的呼吸道病毒专家,前期参与了CDC进行的七项流感病毒测试项目。必须要格外注意的是,Lindstrom只负责设计,不参与制造过程。

请大家记住这个设计的具体方案,该设计的“独特”之处,既是试剂盒“出错”的地方,也是揪出后面污染原因的关键。

要想知道为什么,我们首先得来了解试剂盒的原理。

这种试剂盒含有两种成分,主要针对病毒基因组的不同序列。但是,CDC还为该工具包配备了第三部分,也就是笔者说的“独特”之处,即泛冠状病毒部分,这一发现是为了确定更广泛的冠状病毒毒株。然而此时世界卫生组织(WHO)已经建议,开发的测试可以不包括这个额外的功能。

1月17号CDC国家免疫和呼吸疾病中心(National Center for and Respiratory Diseases)主任南希·梅索尼埃(Nancy Messonnier)额外的泛冠状病毒成分

Nancy Messonnier

当然,这个额外的测试成分也并不是完全没有用,CDC的科学家们可能希望提高试剂盒在区分新冠病毒和其他冠状病毒毒株方面的可靠性。但很多其他专家说,这种额外的检测成分对对新冠来说是不必需的,疫情初期最重要的是检测速度,额外的检测成分会让检测变得复杂。

美国联邦调查局(FBI)2001年调查炭疽病毒事件的负责人凯姆也指出,在已知的冠状病毒中,和新冠病毒基因最接近的是SARS。虽然SARS和新冠病毒在用聚合酶链式反应(PCR)分子检测时有85%是相同的,但这15%的(巨大)差距足以被PCR区别开来。而且新冠病毒有一个独特的基因序列,开发一种检验方法其实并不难。凯姆认为,额外的检测片段是非必要的

清楚了试剂盒设计上的“独特”后,我们来看看这个“独特”是如何锁定导致试剂盒出问题的根本原因

让我们跟着时间轴一步步拨开迷雾,寻找真相。

1月21日,Messonnier宣布,CDC已经“确定开发”了新冠病毒的检测的新方法,并使用它来确认美国的第一例新冠病例,这是一名来自武汉地区的华盛顿州男子。在成功诊断出第一个美国病人后,CDC的技术人员开始了试剂盒第二阶段的开发。

有必要注意一下的是,设计出炉之后,CDC并没有交给其他公司去生产试剂盒,而是在自己的实验室开始组装试剂盒

1月下旬,CDC把生产好的试剂盒分发给了全国各地的26个公共卫生实验室,开始检测工作。

新冠检测需要多个步骤才能完成,首先是医务人员用棉签从一个人的鼻腔或咽喉处收集粘液样本,样本放在密封容器内然后送到实验室。随后实验人员从样本中提取核酸RNA(新冠是一种RNA病毒),再在酶的作用下将RNA转化为DNA。

在取得了DNA后,就能够直接进行PCR反应,该过程旨在复制和扩增冠状病毒基因组的目标区域。如果病毒在原始样本中存在,就会释放出一种可检测到的荧光染料。

CDC为每个检测盒的三个组件提供了大部分必要的材料。但分析阴性对照样本时,却错误地发出了新型冠状病毒存在的信号

一个州立实验室的监督科学家透露,“在已知的阴性样本中,三个(片段)中的两个是阴性的,但第三个片段有阳性反应”,这第三个片段,就是指泛冠状病毒片段

熟悉试剂盒测试的人士立即觉得,可能是试剂盒存在污染,不过污染水平似乎很低。例如,错误的信号是在分子测试进行了34到36次之后才出现的。检测通常在25到30次时进行。[这里的次数,指的是DNA合成的循环次数,每增加一个循环,DNA的含量就增加一倍。初始DNA含量较少时,通常会使用高循环次数来增加DNA的含量]

但就是这一点点污染,导致所有公共检测实验室几乎全部陷入困境。全国26个公共卫生实验室使用了CDC的试剂盒,其中24个实验室都出现了假阳性反应。

广泛存在的误报指向了一个核心污染源——CDC的试剂盒的制造和组装。要知道,在CDC组装试剂盒的实验室里,即使是一点点类似冠状病毒的物质也可能会引起了污染。

有经验的科学家指出了几种可能性,包括对一个封闭区域的消毒不足,在那里技术人员可能使用了合成的新型冠状病毒材料。对可重复使用的实验室设备的不当处理也会污染试剂。

在原因不确定之前,一些公共卫生实验室的人员发现,在没有第三个组件的情况下,测试也能工作。但是根据CDC的紧急指示,实验室人员不得不按照设计好的步骤来使用该试剂盒

随后,在2月12日的新闻发布会上,CDC国家免疫和呼吸疾病中心主任Messonnier提到了困扰公共卫生实验室的未指明的“问题”。当时,大多数美国诊所和医院仍然无法检测新型冠状病毒。她表示,“我们正在调查所有这样一些问题,以了解哪里出了问题,并防止同样的事情在未来发生。”

根据CDC的数据,截至2月23日,感染该病毒的美国人已攀升至53人,遍及六个州。

2月底,看到疫情迅速发展的FDA终于坐不住了,派出高级官员蒂莫西·斯坦泽尔(Timothy Stenzel)前往位于亚特兰大的CDC中心,和相关科学家会面,并亲自参观了开发和组装试剂盒的实验室区域。

根据对FDA的采访和书面回复,Stenzel将评估CDC是否适合继续在机构内部进行新型冠状病毒测试。他还将评估该机构是否应该被允许制造和分发更多的测试套件。

Stenzel于2018年8月被聘为FDA体外诊断和放射卫生办公室主任,曾接受过内科医生和微生物和免疫学博士的培训。他在杜克大学(Duke University)建立了一个分子诊断实验室,在担任行业高管的15年里,他帮助开发了数十种复杂的检测的新方法,包括一种FDA批准的胰腺癌检测的新方法。

根据FDA的说法,在Stenzel访问CDC期间,他确定新冠病毒测试的问题是由CDC的制造引起的,而不是设计造成的。随后,Stenzel建议CDC官员停止生产这种试剂盒。

紧接着,Stenzel与CDC斡旋,促使该试剂盒最终由总部位于爱荷华州的综合DNA技术公司(Integrated DNA Technologies,IDT)制造。IDT公司成立于1987年,在核酸合成和检测领域有着非常丰富的经验,也拥有成熟的试剂盒产业链。

FDA表示,“由IDT生产的测试已经分发,没有遇到任何问题,因此支持这样的结论”,即CDC的生产失误导致了最初的试剂盒检验失败。

2月28日,也就是中国分发病毒基因序列的47天后,Messonnier终于宣布“实验室可以开始使用现有的CDC检测工具进行仔细的检测”。在新闻发布会上,Messonnier还表示,CDC“确定了试剂盒第三个组成部分是导致不确定结果的原因,可以在不影响准确性的情况下排除第三个部分检测。”

但Messonnier却对FDA建议CDC停止生产内部测试套件一事只字不提。此时此刻,美国只有1007人接受了检测。相比之下,全世界已经进行了超过42万次的测试。

第二天,也就是2月29日,CDC宣布了美国首例死于新冠的病例,患者是华盛顿州一名50多岁的男子。

3月2日,FDA批准了最新的由IDT公司组装的试剂盒的投入使用,而CDC的官员一直对试剂盒的问题守口如瓶。

3月3日的新闻发布会上,Messonnier被问及可能的污染问题时回答到:“污染是一个可能的解释,但还有别的的原因,”同时还补充道,“我真的不能对正在进行的调查发表评论。”

3月11日国会听证会上众议院监督和改革委员会主席卡罗琳·马洛尼表示,“川普政府对新型冠状病毒的检测严重不足,如果你不检测,你就不知道有多少人被感染。”

Robert Redfield

CDC主任罗伯特·雷德菲尔德(Robert Redfield)在证词中概括地描述了试剂盒失败的原因,“第三个套件没有按照我们大家都希望的方式运行,原因要么是试剂盒被污染,要么是不明的生物因素导致了测试材料的故障。”

当委员会成员问及污染问题时,Redfield说:“目前正在对此进行调查,我想我还是不说为好。”

但事实上,审查了内部测试数据的联邦科学家表示,试剂盒放大了本应无DNA的阴性对照样本中的核酸。他说,这种放大模式只可能是由污染造成的,而不是由其他设计或制造缺陷造成的。

科学家们说,CDC生产试剂盒的实验室违反了合理的生产规范,导致用于高灵敏度检测过程的三个测试组件之一受到交叉污染,其很有可能是由于化学混合物在实验室空间中被组装到试剂盒中,而实验室也在处理合成新型冠状病毒材料。科学家们还说,这种近距离接触违反了公认的程序,对病毒检测造成了不良影响。

一位CDC的前主任还透露,如果CDC执行了严格的验证和记录,那么在分发试剂盒之前就应该发现了问题。CDC的实验室标准是基于联邦临床实验室改进修正案。这些协议旨在捕获制造过程中的错误,建立纠正措施,并确保科学家对他们的工作保持详尽的记录。但似乎CDC的监督在关键的时刻失灵了···

总结下来就是,CDC官员花了一个多月的时间才移除不必要的实验步骤,加剧了全国性的检测延误

哈佛大学教授David Liu和加州Scripps研究所创始人/主任Eric Topol的推特对话

现任得克萨斯州加尔维斯顿国家实验室主任、前CDC官员杜克(James Le Duc)告诉《华盛顿邮报》,“当得知检测无法起到应有作用时,我感到难过和尴尬,这真的是CDC一个可怕的污点,对国家也造成了毁灭性的影响”。

内布拉斯加大学医学中心(University of Nebraska Medical Center)的医生詹姆斯·劳勒(James Lawler)也说,“CDC在明知检测结果不佳的情况下,不断加大试验的力度,这确实让我们很难堪。”

目前,CDC拒绝回答有关试剂盒的问题,也拒绝向参与试验设计或生产的人员提供试剂盒。CDC发言人本杰明·海恩斯(Benjamin Haynes)周五发表声明,承认该机构在试剂盒的制造过程中存在不合格的“质量控制”,认为试剂盒的问题可能是“设计问题或制造问题或可能的污染”造成的。Haynes还为CDC的工作进行了辩护,称早期的问题最终得到了解决。

此时此刻,全球已经有232万新冠确诊,美国拥有74万例。CDC需要对这个庞然大数负责吗?

参考资料:

https:///

https:///society/202004/004804525.htm

中国生物技术网诚邀生物领域科学家在我们的平台上,发表和介绍国内外原创的科研成果。

本公众号由中科院微生物研究所微生物资源与大数据中心承办

“如果发现本网站发布的资讯影响到您的版权,可以联系本站!同时欢迎来本站投稿!